Točno porijeklo imena Marko nije sigurno jer postoji više teorija o značenju i etimologiji imena. Moguće je da potiče od latinskog Marcus, što je oblik za rimsko osobno ime.

Po nekim tumačenjima, izvedeno je iz imena Martius, što znači rođen u ožujku, ili iz mas, maris, u značenju muževan. Po drugim izvorima, ime je izvedeno iz reči Mars, kojom se u rimskoj mitologiji nazivao bog rata. Postoji teorija da je u osnovi imena latinska reč marceo, u značenju biti slab, uveo, mlitav.